Genomic analysis on Brazilian strains of Anaplasma marginale / Análise genômica de cepas Brasileiras de Anaplasma marginale

Abstract Anaplasma marginale is a vector-borne pathogen that causes a disease known as anaplasmosis. No sequenced genomes of Brazilian strains are yet available. The aim of this work was to compare whole genomes of Brazilian strains of A. marginale (Palmeira and Jaboticabal) with genomes of strains from other regions (USA and Australia strains). Genome sequencing of Brazilian strains was performed by means of next-generation sequencing. Reads were mapped using the genome of the Florida strain of A. marginale as a reference sequence. Single nucleotide polymorphisms (SNPs) and insertions/deletions (INDELs) were identified. The data showed that two Brazilian strains grouped together in one particular clade, which grouped in a larger American group together with North American strains. Moreover, some important differences in surface proteins between the two Brazilian isolates can be discerned. These results shed light on the evolutionary history of A. marginale and provide the first genome information on South American isolates. Assessing the genome sequences of strains from different regions is essential for increasing knowledge of the pan-genome of this bacteria.

Resumo Anaplasma marginale é um patógeno transmitido por vetores que causam uma doença conhecida como anaplasmose. Até a presente data, não há genomas sequenciados de cepas brasileiras. O objetivo deste estudo foi comparar o genoma completo das cepas brasileiras de A. marginale (Palmeira e Jaboticabal) com os genomas de cepas de outras regiões (cepas dos EUA e Austrália). As sequências dos genomas das cepas brasileiras foram obtidas mediante sequenciamento de nova geração. As "reads" foram mapeadas usando-se como referência o genoma de A. marginale da cepa Florida. Foram identificados polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs) e analisadas inserções/deleções (INDELs). As duas linhagens brasileiras se agruparam em um clado particular que, por sua vez, agrupou-se em um grupo maior junto com as linhagens norte-americanas. Além disso, foram identificadas diferenças significativas nas proteínas de superfície entre os dois isolados brasileiros. Esses resultados lançam luz sobre a história evolutiva de A. marginale e fornecem as primeiras informações de genomas de isolados sul-americanos. Avaliar as sequências de genomas de cepas de diferentes regiões é essencial para aumentar o conhecimento do pan-genoma dessa bactéria.

First molecular detection of Mycoplasma ovis (Hemotropic mycoplasmas) from Sheep in Brazil / Primeira detecção molecular de Mycoplasma ovis (Micoplasmas Hemotrópicos) em Ovinos no Brasil

Abstract Mycoplasma ovis is an emerging zoonotic pathogen with a worldwide distribution and can cause mild to severe hemolytic anemia, icterus, and poor weight gain in animals. Although M. ovis has been described in small ruminants worldwide, data on M. ovis in sheep in Brazil is unknown. The objective of the present study was to present the first report of hemotropic mycoplasma (HM) in sheep from Brazil. We evaluated factors associated with this infection, such age group, tick presence, and anemia. Blood samples were collected from 33 sheep from a farm in southern Brazil and screened for hemoplasmas using PCR. Out of 33 samples, 26 (78.8%) tested positive for M. ovis. The sequencing of positive samples showed 100% identity with multiple M. ovis 16S rDNA sequences. No association was observed between the presence of M. ovis and the FAMACHA© score (p = 0.620). Rhipicephalus (Boophilus) microplus (15/33, 45.4%) was the tick species found on the animals. No significant association between M. ovis infection and presence of ticks (p = 0.4134) and age group (p = 0.4221) was observed. This is the first report of M. ovis infection in sheep from Brazil and only the second report of this pathogen in sheep in Latin America.

Resumo Mycoplasma ovis é um patógeno zoonótico emergente com distribuição mundial e pode causar anemia hemolítica de leve a grave, icterícia e baixo ganho de peso em animais. Embora M. ovis tenha sido descrito em pequenos ruminantes em todo o mundo, os dados sobre M. ovis em ovinos no Brasil são desconhecidos. O objetivo deste estudo foi apresentar o primeiro relato de micoplasmas hemotrópicos em ovinos no Brasil. Avaliamos os fatores associados a essa infecção, como faixa etária, presença de carrapatos e anemia. Amostras de sangue foram coletadas de 33 ovelhas de uma fazenda no sul do Brasil e testadas para hemoplasmas usando a PCR. Das 33 amostras, 26 (78,8%) apresentaram resultado positivo. O sequenciamento das amostras positivas mostrou 100% de identidade com múltiplas sequências de M. ovis 16S rDNA. Não foi observada associação entre a presença de M. ovis e o escore FAMACHA© (p = 0,620). Rhipicephalus (Boophilus) microplus (15/33, 45,4%) foi a espécie de carrapato encontrada nos animais. Não houve associação significativa entre infecção por M. ovis e presença de carrapatos (p = 0,4134) e faixa etária (p = 0,4221). Este é o primeiro relato de infecção por M. ovis em ovinos no Brasil e o segundo relato deste patógeno em ovinos na América Latina.

Pupipara (Diptera, Hippoboscidae) in wild birds attended at a rehabilitation center in southern Brazil / Pupíparas (Diptera, Hippoboscidae) em Aves Silvestres Atendidas em Centro de Reabilitação no Sul do Brasil

Abstract The hippoboscids are cosmopolitan permanent obligate hematophagous ectoparasites of birds, domestic and wild mammals and, occasionally, humans. Some species may act as vectors or hosts of etiological pathogenic agents. The aims of this study were to report on the first cases of Hippoboscidae in Crax blumenbachii and Parabuteo unicinctus; to provide new reports from Brazil on Tyto furcata and Asio stygius parasitized by Icosta americana; to report on individuals of Bubo virginianus, Falco sparverius and Accipiter striatus parasitized by genera Ornithoctona; and to provide new reports on parasitism of O. erythrocephala in the state of Rio Grande do Sul. The birds of prey and C. blumenbachii were attended at a rehabilitation center in Porto Alegre and at a veterinary hospital in Cruz Alta. These new records demonstrate the huge gap that exists regarding studies on avian ectoparasites and highlight potential vectors of hemoparasites for the bird species studied.

Resumo Os hipoboboscídeos são ectoparasitos hematófagos obrigatórios, permanentes e cosmopolitas de aves, mamíferos domésticos e silvestres e, ocasionalmente, humanos. Algumas espécies podem atuar como vetores ou hospedeiros de agentes patogênicos etiológicos. Os objetivos deste estudo foram relatar os primeiros casos de Hippoboscidae em Crax blumenbachii e Parabuteo unicinctus; fornecer novo relato do Brasil sobre Tyto furcata e Asio stygius parasitados por Icosta americana; relatar indivíduos de Bubo virginianus, Falco sparverius e Accipiter striatus parasitados pelo gênero Ornithoctona; e fornecer novos relatos sobre parasitismo de O. erythrocephala no estado do Rio Grande do Sul. As aves de rapina e C. blumenbachii foram atendidas em um centro de reabilitação em Porto Alegre e em um hospital veterinário em Cruz Alta. Esses novos registros demonstram a enorme lacuna que existe em relação aos estudos sobre ectoparasitas aviários e destacam potenciais vetores de hemoparasitos para as espécies de aves estudadas.

Amblyomma aureolatum (Acari: Ixodidae) parasitizing margay (Leopardus wiedii) in Rio Grande do Sul / Amblyomma aureolatum (Acari: Ixodidae) parasitando Gato-Maracajá (Leopardus wiedii) no Rio Grande do Sul

We report the finding of Amblyomma aureolatum (Acari: Ixodidae) parasitizing margay (Leopardus wiedii) in the locality of Gravataí (29º 47' 12.9'' S and 50º 53' 44.1'' W; 241 m alt.), State of Rio Grande do Sul, Southern Brazil. This is the first report of this species of Ixodidae on margay in Southern Brazil. This finding indicates an increased number of hosts for this tick species.

Foi registrado o encontro de Amblyomma aureolatum (Acari: Ixodidae) em gato-maracajá (Leopardus wiedii), na localidade de Gravataí (29º 47' 12,9'' S and 50º 53' 44,1'' O; 241 m alt.), região metropolitana de Porto Alegre, Rio Grande do Sul. Esse é o primeiro registro desse ixodídeo parasitando essa espécie de felídeo e amplia a distribuição de hospedeiros no estado.